Fluxo de trabalho de sequenciamento ChIP

ChIP é uma operação poderosa para enriquecimento seletivo de sequências DNA ligadas por uma proteína específica em células vivas. De qualquer forma, o uso generalizado desta operação tem sido limitado pela falta de uma operação suficientemente robusta para divulgar todas as sequências DNA enriquecidas. A operação ChIP melhora complexos reticulados de proteína-DNA usando um anticorpo contra a proteína de interesse. Para uma boa descrição do protocolo do laboratório molhado ChIP, consulte ChIP-on-chip. Os adaptadores de oligonucleotídeos são então adicionados aos pequenos trechos de DNA que foram ligados à proteína de interesse para permitir o sequenciamento maciço paralelo.

Sequenciamento

Após a seleção do tamanho, todos os fragmentos ChIP-DNA resultantes são sequenciados simultaneamente usando um sequenciador de genoma. Uma única execução de sequenciamento pode verificar associações de todo o genoma com alta resolução, o que significa que os recursos podem ser localizados claramente nos cromossomos. ChIP-chip, por outro lado, requer grandes conjuntos de matrizes de mosaico para resolução mais baixa.

Imagem 129A | Visão geral do fluxo de trabalho da parte do laboratório seco de um experimento ChIP-on-chip. | marcado como domínio público | Page URL : (https://en.wikipedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_dry-lab.png) do Wikimedia Commons

Autor : Milos Pawlowski

Referências:

Técnicas usuais de biologia molecular I

Ferramentas de Biologia Molecular II